研究方向：宿主动物肠道环境中具有10倍于宿主细胞数量的微生物，其中包括益生菌、病原菌、条件致病菌等，这些微生物共同作用，参与宿主健康和疾病的调控。课题组感兴趣的科学问题包括：1）微生物培养组学：通过多学科组学交叉技术，建立肠道微生物菌株库和对应噬菌体库；2）肠道微生物应答宿主信号，参与宿主免疫、代谢调节的分子机理；3）微纳肠道微生物机器人研制：利用合成生物学技术和纳米医药技术强化肠道微生物的功能。