贺永主要研究方向：（1）采用无创的多模态神经影像技术（如结构、功能、弥散等）研究活体人脑结构和功能连接组的构建、描述、评价计算方法和计算模型，并探索其认知功能和生理基础；（2）采用影像连接组学方法研究人脑网络的发育与神经精神疾病的脑网络受损机制及诊疗评估方法；（3）开发基于神经影像的人脑连接组分析和可视化软硬件计算平台。