Hans interesser er primært optimering indenfor offentlig transport, samt automatisk planlægning i sundhedssektoren og industriel produktion. Jesper er forfatter på over 50 faglige artikler og rapporter og er brugt som reviewer på en lang række af de vigtigste tidsskrifter indenfor operationsanalyse, ligesom han har været medlem af talrige program kommiteer og har hjulpet flere nationale og internationale forskningsråd med vurdering af forskningsansøgninger. Han er medlem af executiv kommitteen for den europæiske sammenslutning af OR-selskaber (EURO) og medredaktør for OR Spectrum og TOP.