黄爱龙教授长期从事感染性疾病发病机制和综合防控研究，在乙肝病毒复制调控、耐药机理、抗病毒药物筛选及相关肝病的发病机制领域取得了多项具有较大影响力的原创成果。近期充分响应国家应对新冠肺炎疫情的重大需求，在新冠肺炎诊断试剂开发以及临床与免疫学特征研究方面成效显著，带领团队成功研发新冠病毒抗原/抗体检测试剂盒（5项国家III类医疗器械证书）以及预防性新冠病毒中和抗体鼻喷剂，荣获“全国抗击新冠肺炎疫情先进个人”称号。在国际著名期刊Nature Medicine(4篇)、Journal of Hepatology、Hepatology等发表SCI收录论文229篇，IF合计890.37，被美国、德国、日本等50多个国家和地区高校及科研机构他引10000余次，其中Nature Medicine单篇文章引用超过5300次，为中国大陆近五年在生物学领域引用最多的学者，成功入选全球学者库，6篇论文入选2021年ESI临床研究高被引论文。近年来主持国家“十二五”、“十三五”传染病科技重大专项，国家自然科学基金委国际联合、区域联合重点项目、重庆市科技局重大研究计划等国家级省部级重大研究项目，近五年获科研经费1.2亿元。授权发明专利17项，获得重庆市自然科学一等奖（第一完成人）、天津市科技进步一等奖、重庆市科技进步奖二等奖等奖项。研究团队获得全国专业技术人才先进集体、全国科技系统抗击新冠肺炎疫情先进集体、全国工人先锋号等荣誉。